首先，需要明确的是，在中国，性行为是否构成犯罪，以及对性行为的定罪标准和程序都有严格的规定。如果女方确实存在证据证明被告侵犯其身体，那么她可以依据刑法中关于强制猥亵、侮辱妇女罪或者强奸罪的相关规定来起诉。 然而，根据您提供的信息，双方在开房时均出示了身份证，这通常被视为一种身份验证的方式，并不意味着没有其他形式的身份确认方法。此外，即使身份证被出示，也不能排除其他人（如旅馆工作人员）也可以提供同样的身份证明。 因此，虽然有身份证作为身份识别的凭证，但并不能完全确保没有其他方式能够证明双方的身份或关系。此外，如果被告真的实施了强奸行为，即使没有直接证据，也可能通过其他间接证据（如监控录像、证人证言等）来证实指控。 总之，建议您的女友寻求专业的法律帮助，以了解她的权利和可能的救济途径。同时，也建议双方冷静地讨论并考虑如何处理当前的情况。