根据您提供的信息，如果夫妻双方共同购买的商铺是按揭购房，并且一方支付了大部分房款（即首付），而另一方仅承担了一部分房款，那么在婚姻关系存续期间发生的债务通常应被视为共同债务。在这种情况下，如果双方决定离婚，那么按照法律规定，该商铺的全部贷款应该是由双方共同偿还。 然而，在实际操作中，具体情况可能会有所不同。例如，如果双方同意将商铺产权进行分割，那么可能需要协商确定各自对房产的价值比例，以及如何分担还款责任。此外，还需要考虑其他因素，如是否已经产生了高额的利息费用，以及是否有提前还款的可能性等。 因此，为了处理好这个情况，建议您与对方详细沟通，明确各自的立场和意愿，并寻求专业的法律意见，以确保自己的权益得到充分保护。同时，也可以考虑聘请一位经验丰富的法律顾问，以便更好地了解相关法律法规，并为您的案件提供专业的法律支持。