首先，需要明确的是，合同的条款应该清晰、具体且明确无误。如果在签订合同时，双方对于租赁范围或者使用条件未做明确规定，则可能产生纠纷。 在这种情况下，如果乙方认为自己仅租用了其中的一间车间，并且该合同并未明确指出是租用整座工厂还是单个车间，那么可能存在风险。但这种风险是否能被完全排除，取决于具体情况和相关法律规定。 从法律角度分析，除非合同中有特别约定或规定，否则通常认为甲乙双方共同拥有厂房内的所有空间，包括出租给乙方的那部分空间。因此，即使乙方只是租用了其中的一部分，也不能简单地推断出乙方已经获得了整座工厂的所有权。 在遇到此类情况时，建议双方通过协商解决争议，寻求一个公平合理的解决方案。如果无法达成一致，可以考虑向法院提起诉讼，由法官根据事实和法律规定作出裁决。在诉讼过程中，可以通过证据证明乙方确实只租用了其中的部分车间，并不存在整体占有厂房的情况。 总之，在处理这类合同纠纷时，应当仔细阅读并理解合同的具体条款，确保自己的权益得到充分保护。如果不确定如何操作，最好咨询专业的法律顾问以获得准确的法律意见。