在处理孩子的抚养权问题时，法院通常会考虑多个因素，包括但不限于双方的经济状况、教育背景、工作情况、家庭环境等。对于一个三个月大的婴儿来说，母亲可能需要更多的照顾和陪伴，因此在判决中可能会倾向于女方。 然而，最终的决定取决于具体的案情和法律规定。如果您正在处理这个案件，建议您咨询专业的律师以获取更详细的信息和指导。同时，您可以尝试与对方协商达成协议，或者通过调解等方式来解决这个问题。