关于商标代理合同纠纷的管辖权问题，首先需要查看合同中是否有关于管辖权的明确约定。如果合同中已经约定了具体的管辖法院，那么应当按照合同的约定来确定管辖权。如果合同中没有明确约定，根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。 在您描述的情况中，如果合同约定了三个月内办理，但代理方逾期20天，导致另一家已经办理了相同商标，那么代理方可能存在违约行为。在这种情况下，如果需要提起诉讼，可以依据合同履行地或者被告住所地来确定管辖法院。如果代理公司在北京，而委托方在呼市，委托方可以选择在呼市提起诉讼，也可以选择在北京提起诉讼，具体选择哪个法院取决于哪个法院更有利于维护自己的合法权益。 此外，如果合同中约定了仲裁条款，那么纠纷应当提交至约定的仲裁机构进行仲裁，而不是通过法院诉讼解决。在没有仲裁条款的情况下，双方可以协商解决，协商不成的，可以通过法律途径解决纠纷。