您好！根据您描述的情况，可以考虑以下几种方式来分配股权。 比例分配。如果双方同意按照投资额的比例进行分配，那么甲方可持有40%的股份，乙方可持有60%的股份。 共同协商。如果双方在经营过程中意见不一或者分歧较大，可以通过平等协商的方式确定各自的持股比例。这需要考虑到各方的利益平衡以及未来发展的需求。 第三方评估。如果您认为直接协商难以达成一致，可以寻求专业的第三方机构（如会计师事务所或律师事务所）的帮助，对股权分配进行公正评估。 对于后期店面亏损的情况，建议双方首先分析亏损的原因，并尝试找到解决方案。例如，是否是因为管理不当导致成本控制不佳；还是因为市场需求变化影响了销售业绩等。如果亏损是由于一方的责任造成的，另一方有权要求其承担相应的赔偿责任。同时，也可以通过谈判确定如何分担损失，比如按比例承担责任，或者通过其他方式进行补偿。 请注意，以上仅为一般性建议，具体情况还需结合具体情况进行分析和讨论。希望我的回答能帮到您！