在婚姻关系存续期间签订的住房公积金组合借款合同中，通常会涉及到双方作为共同借款人的约定。如果该合同明确约定女方也可以成为共同借款人，则她有权行使自己的权利和权益。 根据我国《民法典》及相关法律法规的规定，夫妻双方对共有财产享有平等的所有权，并承担相应的义务。因此，在婚姻关系存续期间，一方因个人需要而购买房屋或其他资产时，另一方也有权要求其提供一定的经济支持或同意其单独购买。在这种情况下，即使债务尚未全部偿还，女方仍有权申请使用住房公积金来购买房屋。 然而，具体到你提到的情况，即女方想要通过住房公积金购买房屋，且男方不同意的情况下，这可能涉及到了夫妻之间的财产分割以及债权债务处理的问题。此时，建议咨询专业的法律顾问以获得更具体的法律意见，以便了解相关法律规定并做出明智的选择。同时，考虑到婚姻关系中的复杂性和不确定性，建议在进行任何重大决定之前，考虑清楚所有的后果和风险。