《中华人民共和国劳动法》规定，劳动者应当按照约定和国家规定，认真履行劳动合同，完成工作任务。用人单位不得以任何理由扣押员工的身份证件等证件。否则，可能会构成非法拘禁罪或者侵犯公民人身权利罪。 因此，如果用人单位扣押员工的指纹身份证件，这将违反劳动法的规定，并可能构成犯罪行为。建议及时向当地人力资源和社会保障部门投诉或举报此事，以维护自身的合法权益。同时，也可以考虑寻求法律帮助，通过合法途径解决此问题。