您好！根据您的描述，您已经向仲裁机构提交了案件，并且正在等待仲裁结果。在此期间，如果对方公司仍然要求进行第二次鉴定，建议您与对方沟通，了解原因并尝试解决争议。如果您认为第二次鉴定是不必要的或者不公平的，您可以考虑提出抗辩或请求重新评估。在处理此类纠纷时，及时沟通和寻求专业的法律帮助是非常重要的。