《中华人民共和国劳动民法典》第三十九条规定。“劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。”如果公司在签订合同时明确约定需要从工资中扣除培训费用，并且该条款并未违反法律法规的规定，则该公司有权要求员工按照合同约定支付相应的培训费用。然而，在这种情况下，公司必须确保该条款是双方同意并书面确认的，否则可能面临赔偿责任的风险。 因此，在处理此类争议时，建议您详细阅读劳动合同中的相关条款，并与公司的法律顾问进行沟通，以确保您的权益得到充分保护。