您好！在处理房产纠纷时，建议您寻求专业的法律帮助。首先，需要明确的是，您和您的配偶共同购买了该公寓，并且房贷由你们两人共同偿还。因此，对于首付款的部分，除非有特别约定或法律规定，通常不会被视为母亲的个人财产。 关于如何保护母亲的权益，建议您可以与配偶进行沟通，协商解决办法。如果存在争议或者无法达成一致，可以考虑通过诉讼途径来解决。在起诉前，建议您收集相关证据，包括但不限于购房合同、还款记录等，以便更好地维护自己的合法权益。 最后，为了更好地解决问题，建议您尽快联系专业的律师进行咨询和指导。他们能够提供更具体、有效的解决方案，帮助您妥善处理房产纠纷。