在处理有限责任公司的股东退出问题时，首先需要确认该股东是否已经履行了相应的出资义务。如果该股东已完全履行了其应承担的出资责任，则可以按照公司章程的规定进行股权转让或其他方式退出。 如果该股东尚未完全履行出资义务，但其持有股权比例低于法定最低持股比例（通常为5%），那么可以通过签订股权转让协议的方式将其持有的股份转让给其他股东或第三方，以实现其退出的目的。需要注意的是，在这种情况下，新加入的投资者可能需要对原股东的出资情况进行评估和补偿，并确保新的股东能够满足规定的最低持股比例要求。 此外，如果该股东持有大量未出资股权，且无法通过股权转让等方式变现，可能需要考虑通过诉讼程序请求法院强制执行其出资义务，或者寻求法律援助来保护自己的权益。 总之，在处理有限责任公司股东退出的问题时，应当根据具体情况采取适当的措施，确保公司运营的正常进行以及所有股东的权利得到保障。