根据《中华人民共和国劳动法》的规定，用人单位与劳动者协商一致可以变更劳动合同约定的内容，但应当提前书面通知劳动者或者额外支付一个月的工资。在本案例中，如果双方已经就工作时间和加班费等事项达成了一致，并且签订了书面协议，则可以按照新的规定执行。但是，如果这种变更对劳动者不利或不符合法律规定，则可能构成违法解除劳动合同，劳动者有权要求继续履行原劳动合同或者主张赔偿金等其他权利。因此，在具体操作时，建议咨询专业的法律人士以确保自己的合法权益得到保障。