加班工资应当根据实际工作时间计算，并且应支付不低于劳动者本人小时工资标准的150%的工资。在您的情况下，如果底薪为3000元/月，则扣除一天年休假后，剩余的工资将低于最低工资标准，这不符合法律规定。 建议您向当地劳动监察部门或人力资源社会保障部门投诉，要求用人单位按法定标准支付加班工资，并依法进行补偿。同时，您可以考虑通过法律途径解决争议，保护自己的合法权益不受侵害。