根据您提供的信息，您在购买并投资装修了三间商品房后，发现主体消防不合格，这可能导致了一定的经济损失。您已经投入了50万元，并且消防工程已经进行了半年。现在对方想要收回房屋，而您与对方签订的租赁合同期限为一年。 首先，如果房屋的消防不合格是由于房屋本身的质量问题，您作为承租人有权要求出租方承担相应的责任。根据《中华人民共和国合同法》的相关规定，出租人应当保证出租的房屋符合约定的使用目的，并且符合安全使用的要求。如果房屋存在安全隐患，出租方应当负责修缮或者赔偿损失。 其次，如果对方在您投入大量资金进行装修和消防工程后要求收回房屋，可能构成违约。您可以根据合同条款和实际情况，要求对方承担违约责任，包括但不限于赔偿因违约造成的损失。 最后，如果双方无法协商解决，您可以考虑通过法律途径解决争议，比如向人民法院提起诉讼，要求对方承担违约责任或赔偿损失。在此过程中，保留好所有相关的合同文件、投资凭证、消防不合格的证明等证据，以便在诉讼中使用。 建议您尽快咨询专业律师，以便获得更具体的法律意见和解决方案。