您好！根据我国相关法律规定，结婚登记应当由男女双方共同前往一方常住户口所在地的婚姻登记机关进行。因此，在这种情况下，您需要到巴彦县的婚姻登记机关办理结婚登记手续。 至于孩子出生后是否会影响孩子的户籍迁移和准生证申请，这取决于当地的户籍管理政策和相关政策法规。建议您咨询当地的相关机构或专业人士以获取更准确的信息。同时，如果您的情况符合相关的法律法规要求，通常不会对子女的户籍迁移和准生证申请产生不利影响。