根据《中华人民共和国公司法》的规定，自然人股东的股权转让应当经过法定程序，即需要到工商行政管理部门进行登记。因此，如果在1999年私下将股份转让给他人而未办理相关手续，则该转让行为可能不具有法律效力。 然而，需要注意的是，具体的法律规定可能会因国家或地区的不同而有所差异。如果您有关于股权或其他与公司法相关的具体问题，请提供更详细的信息以便我能够给出更为准确的回答。