《中华人民共和国劳动法》规定，劳动者有权利享有休息休假的权利。因此，用人单位不得无故扣除员工的工资或福利待遇。 根据上述法律规定，如果员工因旷工被公司扣款，那么这种行为是不合法的。根据相关法律法规的规定，只有在确有证据证明员工严重违反规章制度的情况下，才可以对员工进行罚款或其他处罚措施。但是，在没有明确证据的情况下，仅凭单方面决定来扣除员工的工资或福利，这是违法的。 因此，建议您与公司的管理人员沟通，并要求他们提供足够的证据和理由来支持他们的决定，以确保您的合法权益得到保障。同时，您可以考虑向当地的劳动监察部门投诉，以保护自己的权益。