尊敬的用户，您的问题涉及到土地使用和树木保护的问题。根据法律规定，如果租户（乙方）在耕地上种植了树木并决定出售或转让这些树木，那么他们有权自行处理这些树木及其附属物。然而，在这种情况下，甲方（出租方）有权对乙方的行为提出异议，并要求赔偿因树木被挖掘而造成的损失。 关于您提到的村委会是否可以阻止乙方挖土以及乙方是否有权带走树苗及其根系，这取决于当地的土地使用管理和保护规定。通常，农村地区可能允许农民保留其耕地上原有的树木作为林木资源，但在某些情况下，可能会限制或禁止过度砍伐行为，以保护生态环境和农业可持续发展。 因此，建议您详细查阅当地的法律法规，了解有关土地使用和环境保护的规定。如果您遇到实际问题，请及时寻求专业的法律意见，以便更好地维护自己的权益。