您的情况可能涉及到土地使用权纠纷和相邻关系处理的问题。根据法律规定，农民集体所有的土地属于国家所有，未经法定程序不得买卖或转让。因此，您父亲所耕种的土地应该归国家所有。 关于您提到的“自研地”，虽然没有明确指出是否为合法的私有土地，但根据我国《中华人民共和国民法典》的规定，农村集体经济组织或者村民委员会可以依法批准本集体经济组织内的农户开垦荒地和其他荒废土地，并发给承包经营合同，承包者有权按照合同约定取得土地承包经营权。 如果村委会出具了相关证明并表示该地块是永久性的，那么这可能是您父亲享有合法使用权的基础。然而，由于您父亲已经放弃了这块土地上的种植活动，并且牛圈的使用也超出了合理期限，这可能会导致对他人权益的侵犯。在这种情况下，建议您与对方协商解决争议，如无法达成一致，则可以通过诉讼途径寻求司法解决。 最后，强烈建议您收集相关的证据材料，包括但不限于村委会的证明文件、土地使用的记录等，以便在必要时作为证据使用。同时，了解当地的法律法规及政策，以更好地维护自己的合法权益。