在离婚协议中约定房屋归子女所有，并且子女未满18周岁由母亲作为监护人，意味着母亲拥有对房屋的居住权。根据我国相关法律规定，未成年人的父母或者其他监护人在未成年子女之间有平等的教育和保护的权利，因此，母亲作为监护人有权要求居住该房产。 然而，孩子的生父是否能够阻止母亲住在该房产上，取决于具体情况。如果该生父与母亲共同生活在一起，并且没有违反家庭法的规定，那么他通常无权阻止母亲享有对该房产的居住权。此外，如果该生父提出异议并提供了充分的理由证明其权利受到侵害，例如认为母亲存在虐待行为等，法院可能会考虑介入处理这一问题。 总之，在处理此类争议时，需要综合考虑多个因素，包括但不限于双方之间的关系、法律规定以及可能存在的利益冲突。最终决定应基于具体的事实和情况做出，以确保公正和合理的解决方案。