在处理劳动争议时，应遵循公平合理的原则。如果劳动合同中明确了员工有权选择工作地点，且双方已经就该条款达成一致，并签署了书面协议，则通常情况下，员工可以选择新工厂的工作地点。然而，在这种情况下，员工是否可以获得补偿则取决于具体情况。 如果员工自愿离开原工厂到新工厂工作，那么公司可能会支付一定数额的经济补偿金作为对员工损失的一种补偿。这通常涉及计算员工因搬家或寻找新住所而产生的费用，以及可能因此导致的生活不便或其他经济损失。 此外，根据当地法律法规，员工是否有权获得补偿还取决于合同的具体规定和相关法律规定。一些地区可能会有特定的规定或标准来确定是否给予补偿，或者员工是否有资格获得赔偿。 总之，在处理此类案件时，需要仔细分析具体情况进行判断。建议您与法律顾问详细讨论，以确保您的权益得到有效保障。