在处理农民工工伤赔偿案件时，是否按照劳动合同中约定的工资标准进行赔偿，需要根据具体案情和法律规定来判断。 首先，关于“合同工资”与实际工资之间的关系，我国劳动法规定了最低工资保障制度。劳动者应当获得不低于当地最低工资标准的报酬。因此，在计算工伤赔偿金时，应优先考虑国家规定的最低工资标准。 其次，如果劳动合同中明确约定了特定的工资标准，则按照该约定执行；否则，应以用人单位的实际支付情况作为依据。用人单位未按时足额支付工资的，劳动者可以向劳动行政部门举报投诉，要求依法处理。 需要注意的是，实践中可能还会涉及到其他因素，如工伤等级、医疗费用、伤残程度等，这些都会影响最终的赔偿数额。因此，对于具体的案例，建议咨询专业的法律人士或参考相关法律法规进行详细分析和指导。