根据法律规定，如果员工在入职不到三个月内因意外事故或疾病死亡，且经法定程序确认为非工伤，那么公司的赔偿责任可能会有所不同。 首先，如果员工的死亡是由其他原因引起的（如交通事故），并且公司能够证明该事件是非工作导致的，那么公司可能不需要承担任何赔偿责任。 其次，如果员工的死亡是由于公司提供的工作条件或者安全措施不当造成的，而且公司未能采取合理预防措施防止此类事件的发生，那么公司可能会被认定为存在过失，需要承担一定的赔偿责任。 最后，如果员工的死亡是由于工作环境中的职业病或其他职业伤害导致的，而公司未能提供必要的防护措施，则公司也可能需要承担责任。 需要注意的是，具体的赔偿数额将取决于当地法律法规和相关证据的具体情况。因此，在处理类似案件时，建议寻求专业的法律意见以获得准确的指导和帮助。