《中华人民共和国农村土地承包法》规定，农民集体所有的土地由本集体经济组织的成员承包经营，从事种植业、林业、畜牧业、渔业生产。因此，如果村民委员会代表全体村民利益与政府签订村村通道路建设工程合同，并将该部分工程发包给村委会所属的自然村农户，则应当视为合法。 然而，在实际操作中，为了保证公平公正，应当按照相关法律规定，明确界定村委会的职责和权利范围，确保工程质量和安全，同时保障村民的利益不受损害。此外，还应建立有效的监督机制，确保项目实施过程中的透明度和公开性。