根据您描述的情况，如果您的员工向法院提起劳动仲裁并主张您的责任，而被告的主体是企业的法定代表人而不是您，这种情况可能会对您的案件产生不利影响。在这种情况下，可能的原因包括。 法院通常会将原告的诉求直接传达给被告，即使原告不是实际的责任方。 被告作为法定代表人的行为可能会被视为代表了公司的行为。 然而，具体的结果取决于多个因素，包括但不限于证据支持的程度、法院的管辖权以及是否有其他有效的替代性解决方案等。因此，在这种情况下，建议您及时寻求专业的法律意见，以便了解最合适的应对策略和策略。