《中华人民共和国农村土地承包法》规定，农民集体所有的土地由本集体经济组织的成员承包经营，从事种植业、林业、畜牧业、渔业生产。因此，如果村民委员会擅自改变土地用途或者使用方式，导致村民的土地使用权受到侵害，是不合法的。根据法律规定，任何单位和个人不得侵占、买卖或者以其他形式非法转让土地。 在实践中，如果村民认为自己的土地被不当使用或侵犯了其合法权益，可以向当地人民政府申请处理，并寻求法律援助。同时，也可以通过协商、调解等方式解决争议，争取合理合法的解决方案。如果无法达成一致意见，可以通过诉讼途径解决纠纷。