根据《中华人民共和国水法》规定，任何单位和个人不得侵占、破坏或者擅自改变水资源的所有权和使用权。因此，如果公司认为其使用的水源属于自己的所有，则有权要求村民停止侵害。同时，如果村民的行为已经对公司的正常生产造成了影响，可以向法院提起诉讼，要求赔偿损失。 此外，建议公司在与村民沟通时，尽量采取和平协商的方式解决问题，并保留相关证据以备不时之需。在处理类似纠纷时，应遵循合法、公正的原则，确保双方利益得到有效保护。