在处理此类争议时，仲裁机构通常会根据实际工作情况和合同约定来确定劳动者应得的工资金额。在这种情况下，由于存在打卡记录不清楚的情况，可能需要提供其他证据来支持劳动者的工资收入。此外，如果劳动合同中明确约定了每月一定的费用，如班费等，也需要考虑是否已经包含在工资总额内。 对于经济补偿金的问题，根据《中华人民共和国劳动民法典》的相关规定，当企业违法解除或终止劳动合同，劳动者有权要求单位支付经济补偿金。因此，在仲裁过程中，可以详细说明劳动合同中的相关条款以及企业违反合同的行为，并提交相关的证据文件，以支持经济补偿金的请求。 总之，在处理这类争议时，关键在于收集并充分展示能够证明工资及经济补偿金合理性的证据。同时，保持良好的沟通技巧和专业的证据准备也是赢得仲裁的关键。