您的描述中存在一些混淆之处。根据我国劳动法的规定，员工在工作过程中发生意外伤害，通常情况下应由雇主承担赔偿责任，并不涉及扣除工资或医药费用的问题。 关于工伤期间的待遇和医疗费用的支付，按照《中华人民共和国社会保险法》等法律法规的规定，员工因工负伤或患职业病后，可以享受以下待遇。 一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金（视具体情况而定）。 工伤保险基金按规定支付的医疗费用。 工伤职工的生活护理费（如需要生活护理）。 其他相关待遇，如精神抚慰金、交通费等。 因此，在您所描述的情况下，除非有明确法律规定或者协议约定，否则不应该将医药费用直接从工资中扣除。建议您与雇主沟通清楚双方的权利义务，必要时寻求法律帮助以维护自身合法权益。