您好，根据我国相关法律法规的规定，员工在工作期间因公受伤并需要住院治疗时，其医疗费用应由用人单位承担。因此，在您所描述的情况下，如果您的伤势是由于工作原因导致的，并且医院出具了相应的诊断证明和病历，您可以向单位申请工伤认定。 关于新农合报销的问题，具体还需了解当地的相关政策。一般来说，新农合制度规定，对于因工受伤或患职业病等情形下产生的医疗费用，可以按照相关规定申请报销。但是，具体的报销流程和标准可能会有所不同，建议您与当地的社保部门或医疗机构联系，获取更详细的信息。 需要注意的是，虽然新农合制度覆盖范围广，但并非所有类型的医疗费用都能报销，而且报销的比例也会根据不同地区和具体情况而有所差异。因此，在进行报销前，请务必详细了解相关政策和程序，确保自己的权益得到充分保障。同时，如果您对公司的处理方式有疑问，也可以考虑通过劳动仲裁等方式维护自己的合法权益。