您好，根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位与劳动者签订劳动合同应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。如果您在签订三方协议时明确约定了毕业生需要完成毕业论文才能正式入职的要求，并且您的毕业论文已经顺利完成并得到了认可，那么您有权依据该约定要求提前解除合同。 关于是否可以要求公司支付违约金，这取决于双方的具体约定。一般来说，在合同中明确约定的情况下，如果毕业生能够提供确实证据证明自己符合合同约定的条件，则有权要求公司支付相应的违约金。 请注意，具体的处理方式可能会因地区法规和公司的具体情况而有所不同，请确保您所处地区的相关法律法规及公司政策都已了解清楚。同时，建议您及时与公司沟通，寻求解决问题的最佳途径。