《中华人民共和国爆炸物品安全管理条例》第三十条规定。“申请领取民用爆炸物品生产许可证的，应当向所在地省级人民政府公安机关提出申请，并提交符合本条例规定的申请材料。”第三十一条规定。“民用爆炸物品生产企业凭安全评估报告和许可证书，依法取得民用爆炸物品安全生产许可证。” 因此，企业未经其所有者或其他股东同意，擅自注销爆破证的行为是不合法的。根据法律规定，任何单位和个人不得非法制造、买卖、运输、储存、使用民用爆炸物品。 此外，《中华人民共和国行政强制法》第四十五条规定。“行政机关作出强制执行决定前，应当事先催告当事人履行义务。催告应当以书面形式作出，并载明下列事项。（一）履行义务的期限；（二）履行义务的方式；（三）涉及金钱给付的，应当有明确的金额和给付方式；（四）当事人依法享有的陈述权和申辩权”。 如果该公司未经过批准程序就自行注销了爆破证，可能构成违法行为，需要承担相应的法律责任。建议该企业及时与相关政府部门沟通，了解并遵守相关的法律法规，避免因违规操作而受到不必要的处罚。