根据劳动法的规定，劳动者在工作时间内应享受合法的休息时间，包括正常的出勤时间和加班时间。如果公司未按照合同约定的时间和方式支付加班费，那么这种行为违反了法律规定。 在此情况下，如果公司的行为导致了加班员工的实际出勤时间超过了法定标准（通常为8小时），则这部分超出的部分是属于加班，并应当按照法律规定支付相应的加班费。因此，即使加班员工被错误地视为只出了5个小时的工作时间，这也仍然构成了加班，并且应当按照规定支付加班费。 请注意，上述分析基于一般情况下的理解，具体到每个案件中可能需要考虑更详细的情况。如果您有具体的法律问题，请提供更多的信息以便于进行准确的回答。