在农村集体土地上建造房屋属于合法行为，但需要遵守相关法律规定。如果农民将自建的房屋出售或者出租，并且这些房屋已建成并取得房产证，则该房屋的所有权已经转移给了买方或承租人。 至于您提到的“自己上了二层楼”，如果您指的是在原有建筑物的基础上进行扩建，那么这部分增加的价值应当作为您的投资收益计入收入中。但是，如果您是在原地新建了楼房，那么这部分价值可能被视为新的资产，需要按照相关法律法规处理。 总之，无论哪种情况，都需要根据当地的相关规定和政策来确定如何处理这部分新增价值。建议您向当地的政府部门咨询，以确保自己的权益得到保障。