您好，在处理此类纠纷时，建议您首先收集相关证据，包括但不限于银行流水记录、支付凭证等。您可以向工厂提出书面申请，并说明您的情况，要求工厂按照合同约定退还剩余款项。如果工厂拒绝退款，可以考虑通过劳动仲裁或诉讼等方式维护自己的权益。同时，也可以寻求法律援助，以获得更专业的意见和支持。希望这些建议能对您有所帮助。