我是应届毕业生，今年3月份签了一份实习协议，日期到17年7月底，当时说的是7月底后终止合同，如果双方觉得都满意则继续签约，然后6月14号公司人事叫我递交入职材料并签三年劳动合同，同时说如果没干满三年会牵扯到竞业协议还有一些赔偿，我之前决定合同到7月底后去考研，对劳动合同也不太懂，所以在谈话中就表明自己在未来有另外选择的意向，人事就说不建议我签有关入职的合同，并让我赔偿违约金，同时告知我之前协议中的7月底是在7月底前签订劳动合同的意思，说我理解错了，现在就业信息网已关闭，双方都不能解约，导员说我只能去入职，请问我入职后直接或过几天辞职违法吗？如果公司扣我人事档案该如何处理？公司不让我入职违法吗？