根据中国的《劳动法》和《工伤保险条例》，工伤员工在治疗期间享有停工留薪的权利。如果员工因工伤需要休息三个月，且医生开具了相应的休息证明，那么在这段时间内，员工应当照常获得工资。 如果员工在休息两个月后返回工作岗位，但工厂拒绝支付工资，员工可以采取以下措施维护自己的权益： 1. 首先与工厂沟通，明确说明自己的权益，并要求支付应得的工资。 2. 如果沟通无效，可以向工厂所在地的劳动监察大队投诉，请求劳动监察部门介入调查。 3. 若问题仍未解决，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求工厂支付工资和可能的赔偿。 重要的是保留好所有相关的医疗证明、休息证明以及与工厂沟通的记录，这些都可以作为维权的证据。同时，了解当地的劳动法规和政策，确保自己的权益得到合法保护。