根据《中华人民共和国劳动民法典》第四十六条的规定，用人单位依法解除或者终止劳动合同时，应当支付经济补偿。其中规定了两种情形下可以不支付经济补偿金，即劳动者主动提出解除合同，或者劳动者因单位未及时足额支付劳动报酬而提出解除合同。因此，如果员工在离职前已明确表示不同意扣除其年终奖，并且该行为也符合法律规定的情形，则公司不得再要求扣除其年终奖。 此外，关于“中途离职不发放”这一说法，在实践中并不常见。除非有特殊约定或法律法规另有规定，通常情况下，员工在离职时应得到应有的薪酬和福利待遇。如果公司坚持要从年终奖中扣除，应提供相应的证据证明其合理性和合法性。 综上所述，如果员工明确表示不同意扣除年终奖，并且公司也未能提供相关合法依据，那么公司的做法可能违反了相关法律法规。建议您与公司进行沟通协商，以确保双方权益得到保护。