首先，没有签订劳动合同的情况下，你与公司之间的劳动关系依然存在，根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位自用工之日起一个月内未与劳动者订立书面劳动合同的，应当支付劳动者双倍工资。因此，你有权要求公司支付你未签订书面劳动合同期间的双倍工资。 其次，关于违反保密协议的赔偿问题，如果公司没有证据证明因为你违反保密协议而遭受了实际损失，那么他们要求你赔偿一百万元是没有法律依据的。保密协议的赔偿通常需要证明实际损失的存在。 再次，关于生产不合格产品的问题，如果公司在生产过程中发现问题并指示继续生产，那么由此产生的损失不应由你个人承担。根据《中华人民共和国劳动法》的规定，劳动者因执行用人单位的指令而造成的损失，不应由劳动者承担。 最后，公司扣发你的工资作为赔偿是不合法的。如果公司拒绝支付你应得的工资，你可以通过劳动仲裁或诉讼的方式维护自己的权益。 建议你首先与公司进行协商，如果协商不成，可以向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。在整个过程中，保留好所有与公司的沟通记录和相关证据，以便在必要时作为证据使用。如果公司威胁要与你打官司，你可以考虑聘请律师为你提供专业的法律服务和支持。