电子工厂在处理员工时应遵循劳动法和相关规章制度，确保其行为符合法律规定。如果员工被诊断为患有乙型肝炎（HBV小三阳），根据《中华人民共和国传染病防治法》，用人单位应当采取相应的隔离措施，并及时向当地疾病预防控制机构报告。同时，用人单位也应遵守国家的就业政策，不得因员工健康状况而解除劳动合同。 具体到您的情况，如果员工已经被确诊为HBV小三阳，并且该信息已经告知了公司，那么公司的做法是合理的。但是，在做出任何决定之前，建议您与员工进行沟通，了解他的具体情况以及对工作的适应程度，以便更好地处理这一情况。此外，考虑到员工可能需要进一步治疗或康复的时间，公司也可以考虑提供必要的支持和服务，帮助员工尽快恢复正常工作状态。