根据您提供的信息，您的合同中约定的租金为每年7000元，但实际收取的租金仅为每年8000元。这意味着您已经多付了1000元作为补偿。因此，如果您确实欠房东3000元，那么这个金额应该从您已支付的款项中扣除，而不是从您未支付的款项中扣减。请确保与房东核实具体的情况，并寻求合适的解决方案。