在某些情况下，如果员工是通过中介公司入职并由该中介公司代为缴纳社会保险费，这种做法可能是合法的。一些中介公司可能会代表雇主向社保机构申报员工的保险信息，并承担相应的费用。 然而，具体情况需要根据当地的具体法律规定和相关政策来判断是否合法。建议您先咨询当地的劳动和社会保障局或相关部门，了解相关的法律法规和政策规定。 关于辞职的问题，您可以直接与公司的人力资源部门沟通，说明您的离职意愿和原因。一般来说，在符合相关程序的前提下，公司应该尊重员工的决定，提供合理的辞退补偿，并协助办理离职手续。如果您遇到困难或者无法解决，请寻求专业的法律帮助。