《中华人民共和国刑法》第三百零三条规定。“违反国家规定，运输毒品，情节严重的，处七年以上有期徒刑，并处罚金。”该法第二十六条规定。“对于组织、领导犯罪集团进行犯罪活动的或者在共同犯罪中起主要作用的，是主犯。对于从事一般职务犯罪的或者在共同犯罪中起次要或者辅助作用的，是从犯。对被教唆、胁迫参加犯罪的，应当按照他在共同犯罪中所起的作用处罚。教唆不满十八周岁的人犯罪的，应当从重处罚。” 根据上述法律规定，如果公司的行为构成非法运输、贩卖毒品罪，那么该公司作为组织者和领导者，应承担刑事责任；员工作为参与者，可能构成非法运输、贩卖毒品罪中的从犯。 因此，在这种情况下，即使公司以“谅解书”等非正式方式要求员工赔偿事故损失，这并不改变其作为组织者和领导者应承担的刑事责任。至于员工是否需要赔偿，则取决于他们参与犯罪的具体情况，以及公司在处理员工时是否符合相关法律法规的规定。