根据《中华人民共和国劳动民法典》第三十条规定。“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。”因此，您的老板要求您在年底结清未发的两千元的行为并不合法。如果您认为自己有权获得剩余未发的两千元，则应与公司进行协商或通过法律途径解决。建议您保留相关证据，并寻求法律帮助以维护自己的合法权益。