集体协议是工会与雇主就工资、工作时间、休息休假等事项达成的协议。如果集体协议被劳动行政部门认定为无效或不合法，那么该集体协议可能在某些情况下失去法律效力。 集体协议的有效性取决于多个因素，包括但不限于合法性、是否违反法律法规、是否符合公共利益等等。如果集体协议的内容不符合法律规定，或者对劳动者权益造成了侵害，劳动行政部门有权撤销或废止该协议，并要求重新签订新的集体协议。 因此，在处理集体协议时，应当仔细审查协议的内容和形式，确保其符合法律法规的规定，并且不会侵犯任何一方的权利。如果有疑问，建议寻求专业的法律意见。