你好！可以的。根据《中华人民共和国行政许可法》的规定，申请人可以在申请许可的管辖区域内选择一个或者几个地方提出申请，并且可以根据需要变更住所地。因此，你可以选择将公司的注册地址和经营场所分别设在不同的区域，只要符合当地的法律法规要求即可。不过，在实际操作中，建议与相关政府部门沟通确认具体的政策规定，确保你的行为合法合规。