在处理此类案件时，我们应当遵守相关的法律规定。根据我国相关法律法规，如果员工扣留公司的车辆行驶证是为了索要赔偿金或其他合法理由，并且没有损害公共利益或他人权益，那么其行为是合法的。 然而，在某些情况下，员工可能因误解或者缺乏法律知识而误以为扣留车辆行驶证是一种违法行为。在这种情况下，员工应该寻求专业的法律意见，以确保自己的合法权益不受侵害。 总之，员工的行为是否构成违法需要具体情况具体分析，建议员工在处理此类问题时先咨询专业人士的意见，避免不必要的纠纷。