《中华人民共和国劳动法》规定，用人单位不得违反本法的规定解除劳动合同。在本案中，如果公交公司的员工因卫生打扫不干净被公司用违约金处罚，那么这种做法是不合法的。根据法律规定，劳动者有权享受社会保险和福利待遇，并享有休息休假的权利。因此，即使公司有权利对员工进行罚款或惩罚，也不能以这种方式剥夺员工的基本权益。 此外，公司应当采取合理的措施来提高员工的工作效率和质量，确保工作环境的安全和舒适。如果发现员工存在清洁不达标的情况，应该通过培训、指导等方式帮助其改进，而不是采用经济处罚的方式。只有当员工的行为严重违反了公司规章制度或者给公司造成了重大损失时，才能考虑使用经济处罚的方式来解决。 总之，在处理任何争议时，应充分尊重员工的合法权益，避免滥用权力和手段，保障员工的基本权利和尊严。同时，企业也应注重自身管理能力的提升，从源头上解决问题，维护良好的工作环境和社会秩序。