根据《中华人民共和国劳动民法典》第三十条规定。“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。”因此，即使员工在上班途中发生交通事故，并且因受伤需要休息，也应得到相应的赔偿。如果公司以“只购买了药品”为由拒绝支付工资和全勤奖，可能违反了相关法律规定。 对于员工自行购买药物并进行报销的问题，建议员工首先与肇事方协商解决，看是否可以按照合同条款或保险理赔规则进行索赔。如果无法达成一致，员工也可以寻求第三方调解机构的帮助，或者直接向当地劳动争议仲裁委员会提起诉讼，维护自己的合法权益。 同时，为了减少不必要的纠纷，建议公司在员工上下班期间的安全保障方面加强管理，确保员工的人身安全。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请咨询专业的法律顾问。